故事叙述一只叫暮光闪闪(Twilight Sparkle)的小马为了执行导师塞拉斯提娅公主（Princess Celestia）给她的任务，与助手斯穗龙（Spike）一起来到小马镇学习有关友谊的魔法的知识，其中她认识了苹果杰克（Applejack）、瑞瑞（Ra…

是以未知的遗传学世界为题材，讲述出生就强壮的人，身上装有追踪器，一起被丢置到孤独的世界之中。故事源於达尔文的「物种起源」，能追溯到所有生命体起源的生命的种子被称为「LucA」。